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Tafazzin基因缺失对斑马鱼生长及肌纤维收缩的影响  PDF

  • 车金远 1,2
  • 胡存洁 1,2
  • 王琪 1,2
  • 鲍宝龙 1,2
1. 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306; 2. 上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306

中图分类号: S 917

最近更新:2025-05-21

DOI: 10.12024/jsou.20210703508

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摘要

鱼类骨骼肌中富含大量线粒体,尤其在红肌中线粒体含量很高。线粒体对维持鱼类骨骼肌的收缩具有重要作用。Tafazzintaz)基因作为合成线粒体特异性磷脂心磷脂的重要基因,对线粒体ATP的产生有关键作用。通过对斑马鱼的肌肉组织进行taz基因切片原位杂交,结果显示:taz基因在斑马鱼骨骼肌中大量表达,且特异性表达在肌原纤维的I带中。通过CRISPR/Cas9技术在构建斑马鱼taz缺失突变体taz-/-过程中发现taz缺失后,斑马鱼生长发育缓慢,突变体的体长、体质量、体宽、体高均显著小于野生型斑马鱼(P<0.05)。受精后48 h胚胎的肌动蛋白荧光染色结果显示,taz突变体肌纤维排列变疏松,肌动蛋白长度显著变长(P<0.05)。整体骨骼染色结果显示,taz突变后肌间骨的生长受到抑制。以上结果表明,在斑马鱼中,taz基因影响斑马鱼生长、骨骼肌的收缩及肌间骨的发育。

鱼体内骨骼肌是占体质量比例最大的一类组织(可达40%~60%),在运动过程中是体内代谢最活跃组织之

1-2。鱼类骨骼肌由富含线粒体的快慢肌纤维组成,慢肌纤维中的线粒体数量远大于快肌纤3-5。线粒体的数量决定了两种类型的肌纤维行使不同的功能。快肌纤维线粒体含量少,收缩速度快但容易疲劳,而慢肌纤维中的线粒体数目多,有氧代谢酶活性高,更耐疲劳。鱼类游泳主要依靠肌纤维的收缩,也就是“肌丝滑动”。在肌肉收缩过程中,肌球蛋白水解ATP释放能量,从而完成肌球蛋白细丝移动。该过程中的ATP由位于肌纤维I带中的线粒体氧化磷酸化途径生6。通过对酵母和哺乳动物细胞的亚细胞分离及tafazzin基因标记实验证明tafazzin基因位于线粒体中的内外膜7-11

Tafazzin(taz)基因由BIONE等于1996年发现并命名,编码TAZ蛋

12。TAZ蛋白是一种线粒体酶:磷脂-溶血磷脂转酰基酶,在线粒体中起重要作用。存在于线粒体的内外膜间,它主要的酶促功能是产生成熟的心磷13-14。心磷脂是一种高度特异地分布在线粒体内膜的磷脂,是线粒体进行氧化磷酸化和高效产生ATP的必需分子之一。taz基因突变会引起罕见的X连锁遗传病巴斯综合征(Barth syndrome),患者表现出生长迟缓等症15。随后,在人、酵母和果蝇中均发现taz基因突变导致心磷脂分子种类严重紊乱,证实taz参与心磷脂重1116-17。在斑马鱼中taz基因的敲降导致严重的发育和生长迟缓、明显的心动过缓和心包积液以及全身水肿,这些迹象类似于人类 Barth 综合征心力衰8。目前,尚没有在斑马鱼中敲除taz的表型研究。本研究通过在斑马鱼中构建taz基因功能缺失的突变模型,利用原位杂交及免疫荧光染色探究taz基因在骨骼肌组织的表达位置及功能,明确taz基因在鱼类骨骼肌发育中的作用。

1 材料与方法

1.1 实验材料

斑马鱼AB品系来自中科院上海生命科学研究所,饲养于上海海洋大学水产与生命学院。养殖循环水温度为28.5 ℃。分别于每天8:00和17:00投喂两次,其中幼鱼投喂草履虫,成体鱼投喂卤虫。光照周期为10 h黑暗和14 h光照。实验方案经上海海洋大学动物伦理委员会批准, 并遵守中国科学技术部制定的《实验动物伦理待遇指南》。

1.2 斑马鱼taz基因的切片原位杂交

1.2.1 原位杂交探针合成

根据NCBI网站提供的斑马鱼taz cDNA基因序列设计探针引物,上游引物F:CTGGTCCAAAGGTAACTGTATG;下游引物R:GCTGGACATTCTTCCAGATG。克隆探针序列至pGEM-T载体。大量抽提含目的片段基因的质粒,用限制性内切酶(ThermoFisher Scientific,美国)线性化质粒,用DNA纯化试剂盒[天根生化科技(北京)有限公司]回收线性化的模板质粒,重悬于0.1% DEPC水。用SP6 RNA Polymerase或T7 RNA Polymerase (Promega,美国)合成地高辛(DIG)标记的RNA反义或正义探针,RNA转录反应体系如下:1 μL SP6 或T7 RNA Polymerase,0.5 μL RNase Inhibitor(40 U),2 μL 10×DIG Mix, 2 μL DTT(100 mmol/L),4 μL 5×Transcription buffer,线性化质粒DNA 1 μg,RNase free水补足至20 μL,37 ℃ PCR仪孵育2 h,电泳检测转录效果,若转录成功加1 μL RNase-free DNAase,37 ℃ PCR仪孵育15 min消除DNA模板。然后加入2.2 μL RNase-free LiCl(5 mol/L)和40 μL的无水乙醇(冰预冷),-20 ℃下静置至少4 h沉淀RNA。然后4 ℃ 13 000 r/min离心30 min,去上清,用75%乙醇漂洗,4 ℃ 13 000 r/min离心15 min,去上清,在无菌操作台吹干10 min,最后向RNA沉淀中加30 μL DEPC水溶解,取1 μL进行电泳检测其完整性,并用NanoDrop 2 000测定RNA浓度,保存于-80 ℃备用。

1.2.2 石蜡切片的制备

取1月龄斑马鱼(此时肌肉组织发育基本完全),经麻醉剂处理后用4%多聚甲醛(4% PFA)溶液在室温条件下固定24 h。在显微镜下剪去鳍条组织、去除皮肤鳞片后,将样本于PBS中清洗3次,每次10 min。组织经梯度脱水后,二甲苯处理样本至透明并于65 ℃浸蜡包埋。用Leica轮转式切片机进行连续切片,切片厚度7 μm。

1.2.3 切片原位杂交

将制备好的切片经二甲苯脱蜡,并梯度复水。使用PBST孵育数次,向组织上滴加20 μL的10 μg/mL蛋白酶K,37 ℃消化3 min,暴露目的核苷酸。经甘氨酸处理后,使用PBST漂洗数次后,入5×SSC中平衡15 min,55 ℃预杂交3.5 h。向每张玻片滴加40 μL探针浓度为5 ng/μL的杂交液,置于含少量2×SSC的湿盒中放置于黑暗环境65 ℃过夜(10~12 h)。使用65 ℃的2×SSCT和0.1×SSCT漂洗组织各两次,取出玻片冷却片刻,用少量室温PBST冲洗玻片数次。1%封闭液室温孵育1 h,滴加40 μL用封闭液稀释5 000倍的抗地高辛抗体-AP结合物,室温湿盒孵育2 h,使用适量PBS冲洗后,漂洗数次,AP Buffer浸洗30 min,向玻片上滴加40 μL BCIP-NBT显色液在黑暗条件下显色1~12 h,定时镜检以防显色过度。显色结束后,适量PBST漂洗后,浸洗10 min,再入蒸馏水中浸洗数次,将切片梯度脱水、封片并拍照。

1.3 利用CRISPR/Cas9构建taz-/-突变体

在UCSC数据库上查询斑马鱼taz基因的基因组DNA序列(GeneID: 30526)。根据CRISPR/Cas9基因编辑靶点设计网站(http://genome-asia.ucsc.edu/)选择基因敲除的靶点。利用HiScribe T7 High Yield RNA Synthesis Kit (NEB,cat#E2050)进行体外转录,并用RNA Clean & Concentrator Kit(Zymo Research,cat#R1017)纯化获得sgRNA。将sgRNA(50 pg) 和Cas9 蛋白(Genescript, cat#Z03389-50)混合后用于注射,Cas9蛋白的工作浓度为1 μg/μL,每个胚胎注射量约为1.4 nL。将注射后经检测有效编辑的F0斑马鱼饲养至成年,并进行突变体纯合品系构建。

1.4 免疫荧光染色

对48 hpf斑马鱼的胚胎进行整体荧光染色。胚胎经过0.6 mmol/L麻醉剂(药品名:Ethyl 3-Aminobenzoate methanesulfonata, cat#886862, 麦克林公司)麻醉后,于4% PFA中4 ℃固定过夜。用含0.1% Tween-20的PBST清洗胚胎3次每次10 min。通过冰丙酮处理8 min,以增加细胞膜通透性。PBST清洗30 min后,用phallodin-TRITC[cat#40734ES75,翌圣生物科技(上海)股份有限公司]进行肌动蛋白染色20 min。PBST清洗30 min后,用抗荧光淬灭封片剂[cat#E675011-0010,生工生物工程(上海)股份有限公司]封片。样品经Leica SP8激光扫描共聚焦拍照分析。

1.5 整体骨骼染色及肌间骨分离

利用茜素红染色对3月龄斑马鱼进行整体骨骼染色。斑马鱼经过麻醉剂麻醉后,用4% PFA固定至少24 h。然后,用PBS清洗鱼体30 min,去除多聚甲醛溶液。接着用含1% Tween20的TBST浸泡样品30 min,脱去鱼体表皮脂肪;然后浸泡在V(3% H2O2)∶V(1% KOH)=1∶9溶液中,于强光照下脱去鱼体表皮色素;经1%胰蛋白酶消化至鱼体透明后,用含1%茜素红的1% KOH溶液进行硬骨染色,最后经过甘油梯度进行观察。茜素红染色后的鱼体用于单根肌间骨的分离实验。于解剖镜下进行鱼体解剖,从尾部开始取出肌肉组织中的肌间骨,去除多余肌肉组织后,排列在盖玻片上,最后用50%甘油进行封片。

1.6 数据分析

利用Image J软件进行肌动蛋白长度统计。所有数据均以平均值 ± 标准误表示。使用Grapdhpad 6.0软件进行t检验,P<0.05表示显著性差异。

2 结果与分析

2.1 taz基因的表达分布

对受精后30 d(30 dpf)的斑马鱼躯干进行切片原位杂交,观察taz基因在胚后发育的表达情况。结果显示,在斑马鱼躯干组织,taz基因的mRNA探针在肌原纤维、部分骨组织如鳍条骨、肌隔中均有表达,尤其在肌肉组织中高表达。为了进一步了解taz基因在肌肉组织中的表达,对肌肉组织切片进行局部放大,观察taz基因在肌原纤维中的表达情况(图版Ⅰ)。结果显示,taz基因的mRNA探针信号在肌纤维中表现为明显的明暗带变化,且信号主要位于肌原纤维的I带上,而A带上信号较弱几乎无信号。结果表明taz基因的mRNA探针在肌纤维组织中的表达位置有明显的位置特异性,主要表达于组成肌纤维的单位肌原纤维的I带中。

图版Ⅰ  斑马鱼大侧肌及尾鳍组织taz基因的原位杂交Plate Ⅰ In situ hybridization for taz in skeletal muscle and caudal fin tissue

(a) 尾鳍组织及肌肉组织taz基因探针原位杂交的实验组及反义探针组,n=3; (b) 尾鳍组织及肌肉组织taz基因原位杂交的正义探针杂交图, n=3。

(a) In situ hybridization of caudal fin and skeletal muscle tissue with anti-sense probe; (b) The hybridization with the sense probe of taz; Sample size for experimental group and control are 3.

2.2 利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼taz基因突变体

在斑马鱼中,taz基因共有4个外显子,为成功破坏taz的基因功能,在第一外显子区选择靶点,设计20 bp的靶点序列(图1a)。通过CRISPR/Cas9技术,成功获得了taz突变体taz-/-。结果显示,基因敲除产生了在靶点处增加2个碱基的突变体类型。通过对比野生型和突变体斑马鱼的taz基因的氨基酸序列(图1b),野生型斑马鱼taz基因正常编码262个氨基酸。而突变体的taz基因序列由于靶点位置增加2 bp后,发生了无义突变,使氨基酸的编码提前终止,突变体编码17个氨基酸。将验证有效的F0与野生型外交产生的F1鱼系养至3月龄,剪取3月龄F1尾鳍,使用碱裂解法提取基因组,经PCR测序、比对确定F1突变类型。将筛选出的F1杂合品系内交后获得F2纯合品系。

图1  CRISPR/Cas9构建的taz基因突变类型

Fig.1  taz mutant type constructed by CRISPR/Cas9

(a) taz基因结构及基因敲除靶位点,E1-E4分别为taz基因的4个外显子,ATG为起始密码子,红色下划线区域为基因敲除靶点序列;(b) taz突变体的核苷酸序列及taz突变后编码的氨基酸序列;M为启始甲硫氨酸;绿色碱基为基因敲除后靶点区发生变化的碱基,红色下划线部分的氨基酸为无义突变后提前终止编码的氨基酸。

(a) taz gene structure and gene knockout target site, E1-E4 are the 4 exons of taz gene respectively, ATG is the start codon, the red underlined area is the gene knockout target sequence; (b) The nucleotide sequence of taz-/- and the amino acid sequence encoded by taz-/-, the green base is the change of the target region base after gene knockout, and the amino acid underlined in red is the amino acid whose encoding is terminated prematurely after nonsense mutation.

2.3 斑马鱼taz基因突变后对生长发育的影响

对野生型和taz-/-发育不同时期:受精后48 h(48 hpf)、72 hpf及3月龄的个体发育进行观察(图版Ⅱ)。对比发现,48 hpf时,野生型斑马鱼体表被较多黑色素细胞、体节明显;taz-/-突变体斑马鱼黑色素细胞且体节发育不明显。至72 hpf, taz-/-黑色素细胞开始增加,但数量仍少于野生型斑马鱼。斑马鱼发育至3个月时,无论雌鱼还是雄鱼,taz-/-的体型都远小于野生型。但幼鱼及成鱼突变体均未出现畸形。对taz-/-的生长周期进行统计,并绘制生长曲线(图2)。对比突变体及野生型斑马鱼发育至不同时期的体质量、体长、体宽、体高,结果显示除了1个月的斑马鱼没有显著差异外,从2月龄至4月龄,taz-/-均显著小于野生型斑马鱼(P<0.01)。结果表明,在斑马鱼中,taz基因突变后,斑马鱼的生长发育受到抑制,呈现发育迟缓的现象。

图2  taz突变体和野生斑马鱼的生长曲线

Fig.2  Growth curve of taz mutant and WT zebrafish

*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。

图版Ⅱ  发育不同时期taz-/-与野生型斑马鱼对比图Plate Ⅱ Whole observation of taz-/- and WT zebrafish in different development stages

(a) 野生型斑马鱼发育不同时期的整体图, n=20;(b) taz-/-斑马鱼发育不同时期整体图, n=20。48 hpf,72 hpf标尺为100 μm;3月龄标尺为1 cm。

(a) The whole observations of wild-type zebrafish at different stages of development,n=20;(b)The whole observation of taz-/- at different development stages, n=20.Scale bar: 48 hpf and 72 hpf are 100 μm, 3-month are 1 cm.

2.4 taz基因缺失影响骨骼肌纤维收缩

利用肌动蛋白抗体(鬼笔环肽)对野生型和taz-/-斑马鱼(48 hpf)进行整体荧光染色。结果发现,与野生型斑马鱼相比,taz-/-的肌纤维排列明显疏松(图3a)。肌纤维染色分析发现taz-/-肌纤维的肌动蛋白长度相比野生型明显变宽。进一步对野生型及突变体斑马鱼经过麻醉后并用4% PFA固定,进行鬼笔环肽染色分析。在肌原纤维中,肌动蛋白染色标记的位置位于H带到H带之间(H-H)。对肌动蛋白长度(即H-H距离)进行统计分析,结果显示野生型斑马鱼与taz-/-经过麻醉处理后,taz-/-的H-H长度为(1.12±0.03)μm,而野生型斑马鱼H-H长度为(0.59±0.01)μm,说明taz-/-的肌动蛋白长度显著大于野生型(图3b)。结果表明,taz具有调节肌纤维分化的能力,并且参与调控肌动蛋白丝的收缩。

图3  taz-/-和野生斑马鱼肌纤维中肌动蛋白染色分析

Fig.3  F-actin staining analysis of muscle fibers in taz-/- and WT zebrafish

(a) 斑马鱼整体荧光染色,红色为被鬼笔环肽标记的肌动蛋白;(b) 肌动蛋白宽度统计,n=10;***P<0.001。

(a) Whole immunofluorescence stain for actin,the red color marked the actin stained by phalloidin; (b) Statistical analysis for the width of actin, n=10; ***P<0.001.

2.5 taz基因缺失影响肌间骨发育

对3月龄的taz-/-及野生型斑马鱼进行整体骨骼染色,结果显示,taz-/-的髓弓小骨和脉弓小骨在肌隔位置正常骨化,且钙化程度未见明显变化(图4a)。值得注意的是,相比野生型斑马鱼,taz-/-的髓弓小骨和脉弓小骨的长度明显变短。体外分离单根肌间骨并依次排序,形成肌间骨序列(图 4b)。在taz-/-中,几乎所有的髓弓小骨骨化明显小于同一位置野生型的髓弓小骨。taz-/-的脉弓小骨也明显小于野生型斑马鱼的脉弓小骨。结果说明,taz基因突变后,脉弓小骨和髓弓小骨骨化长度变短,肌间骨的骨化受到一定的影响。

图4  taz-/-和野生斑马鱼整体骨骼染色及单根肌间骨序列

Fig.4  Whole Alizarin stain and single intermuscular bone sequence in taz-/- and WT zebrafish

(a) 斑马鱼整体骨骼染色示意图,黑色箭头指示分别为髓弓小骨和脉弓小骨;黑色实线代表指示整个肌间骨的长度;(b) 体外分离的taz-/-及WT斑马鱼髓弓小骨、脉弓小骨序列;(c) 髓弓小骨和脉弓小骨的平均长度,n=3, *P<0.05。

(a) The whole bone stain of taz-/- and WT zebrafish. The black arrows indicate epineural bones and epipleural bones respectively;The black solid line indicates the whole length of intermuscular bone; (b) The single epineural bones and epipleural bones sequence from tail to head from taz-/- and WT zebrafish isolated in vitro; (c) The mean length of epineural bones and epipleural bones in taz-/- and WT,n=3, *P<0.05.

3 讨论

骨骼肌富含线粒体,线粒体是骨骼肌功能的决定性因素之一。线粒体代谢生成ATP为肌纤维收缩提供能量,这对于骨骼肌的功能维持至关重要。为明确taz基因在斑马鱼骨骼肌发育中的作用,通过切片原位杂交,发现taz基因在斑马鱼骨骼肌纤维中有大量表达,且骨骼肌纤维中的taz基因主要表达于肌小节中I带(明带)位置。线粒体位于骨骼肌纤维的I带,负责提供肌肉收缩过程中肌动蛋白丝滑动所需要的ATP

618。作为线粒体酶酰基转移酶的合成基因taz,在斑马鱼骨骼肌纤维中的定位与taz行使的功能一致。说明taz在骨骼肌纤维中ATP合成细胞器线粒体时也发挥重要作用。除此以外,本研究还发现,taz在斑马鱼中突变后,肌间骨骨化程度变小,说明taz基因在斑马鱼的骨组织发育中也发挥作用。

Taz调控一种线粒体酶:酰基转移酶的合成,是合成成熟形式的心磷脂所必需

18。心磷脂(Cardiolipin, CL)是一种特异的线粒体磷脂,有助于维持线粒体内膜的正常结构,促进ATP的高效合1019。在taz敲除的小鼠骨骼肌来源的C2C12 成肌细胞系中,肌细胞分化受影响,表明taz对肌细胞分化具有重要作20。为了明确taz基因与斑马鱼骨骼肌发育的相关性,利用荧光染色标记肌动蛋白方法检测了野生型和taz-/-突变体斑马鱼48 hpf时期肌纤维的变化。结果显示,taz-/-突变体的肌纤维相比同时期的野生型明显疏松,说明taz参与了斑马鱼肌纤维的分化与增殖。本研究结果表明,骨骼肌的I带中taz基因高表达。I带(肌动蛋白)、A带(肌动蛋白、肌球蛋白)、H带组成了肌纤维的功能单位肌小节,是肌肉收缩的基本单21。通过计算肌动蛋白的长度(H-H带间的长度)来衡量肌动蛋白收缩能22。结果表明,经过同样麻醉处理后,taz-/-的肌动蛋白的长度显著增加。说明taz突变后,肌动蛋白的收缩能力受抑制。taz催化合成的心磷脂是线粒体ATP合成的重要分子。骨骼肌运动主要靠肌纤维的收缩,而肌纤维收缩需要肌球蛋白水解ATP释放能量来完成肌动蛋白的移23。在斑马鱼中,taz缺失后导致的肌动蛋白长度增加,推测与线粒体的ATP合成下降后造成肌球蛋白水解ATP释放能量减少,肌动蛋白的移动受到影响有关。此外,本研究发现taz基因突变后,由肌隔骨化而来的肌间骨的发育受到抑制,表明taz基因也参与斑马鱼肌间骨的发育。原位杂交结果显示,taz基因在斑马鱼肌隔中有表达。文献表明肌间骨由肌隔结缔组织分化而24-27,说明taz可能通过调控肌隔的发育来抑制肌间骨的发育。

通过在斑马鱼中构建taz-/-,并对taz-/-进行生长曲线统计分析,发现taz基因的缺失,虽然不会导致鱼体出现畸形等情况,但会导致斑马鱼生长缓慢。taz基因突变后引起的人、老鼠、酵母等Barth综合征,表现出身材矮小、心肌病变、发育迟缓

7911。在斑马鱼中taz基因缺失后引起的体长缩短、体质量下降、生长缓慢的现象与Barth综合征表型一致,说明taz在斑马鱼中也会引起Barth综合征样表型。

综上,本研究通过切片原位杂交分析了taz基因在斑马鱼躯干大侧肌组织的表达位置。原位杂交显示taz基因在斑马鱼的肌肉组织中的表达呈现组织特异性,主要表达在肌原纤维的I带。通过构建taz缺失突变体,发现taz基因突变后在斑马鱼中会引起Barth综合征表型,且会影响肌动蛋白的收缩。研究结果将为进一步了解taz基因在鱼类中的功能提供理论依据。

利益冲突

作者声明本文无利益冲突

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